剥榴莲的时候最好不要把所有的果肉都剥出来，可以留一些果壳。吃不完的榴莲肉可以用报纸连果壳一起包住，放在室内阴凉处或者冰箱冷藏室内。这样的保存一般能保鲜三天左右。到吃的时候如果闻到酸味或者酒味，就证明已经变质，不应该继续食用了。
冷冻榴莲是最常见也最受欢迎的榴莲保存方式。将果肉剥出，放在密封的保鲜盒或者用保鲜袋装好，放入冰箱的冷冻层。等到要吃的时候稍微解冻，用勺子勺着吃，会有雪糕的口感和风味。榴莲奶昔是处理吃剩的榴莲的一个很不错的方式。把榴莲果肉搅拌至溶烂状，加入等量的牛奶搅拌，然后放进冰箱冷冻室，大概冷冻2小时之后再搅拌一下。这样的二次搅拌可以让奶昔变得更加细腻。
