分解作用是指微生物的呼吸作用,呼吸作用是异化作用中重要的过程。异化作用就是生物的分解代谢。是生物体将体内的大分子转化为小分子并释放出能量的过程。
微生物间的相互作用机制也相当奥秘。例如健康人 肠道 中即有大量细菌存在，称 正常菌群 ，其中包含的细菌种类高达上百种。在肠道环境中这些细菌相互依存，互惠共生。食物、有毒物质甚至药物的分解与吸收，菌群在这些过程中发挥的作用。
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